Forschungsschwerpunkte
Numerische Mathematik
Mathematische Modellierung von atherosklerotischem Plaque
Viele vaskuläre Erkrankungen entstehen aus Atherosklerose. Atherogenesis ist ein Entzündungsprozess, der hauptsächlich von LDL (Low Density Lipoprotein), welches in die intimale Schicht eindringt, ausgelöst wird. Dieses Phänomen wiederum ist lokal gekoppelt zur Blutfluss-abhängigen Änderung der Scherkräfte auf das Endothel. Wir konzentrieren uns auf die numerische Modellierung von Atherogenesis basierend auf Bilddaten der Gefäßstruktur, Blutfluss und vaskulärer Entzündung. Die simulationsbasierende Charakterisierung des Einflusses auf die Plaqueformation auf relavante Parameter sollen letztendlich das Verständnis der Plaqueentwicklung fördern.
Discontinuous Galerkin Methoden
DUNE (Distributed and Unified Numerics Environment)
Vita
Akademische Ausbildung
- Promotionsstudium (Mathematik)
- Mathematik (Diplom), Nebenfach: Informatik
- 2-Fach-Bachelor Mathematik/Informatik
- Mathematik (Diplom), Nebenfach: Informatik
Beruflicher Werdegang
Projekte
- SFB 656 B07 - Mathematische Modellierung atherosklerotischer Plaque-Entstehung basierend auf multi-parametrischen Bildgebungsdaten ( – )
Teilprojekt in DFG-Verbund koordiniert an der Universität Münster: DFG - Sonderforschungsbereich - AdaptHydroMod – Verbundprojekt Adaptive Modellierung gekoppelter hydrologischer Prozesse mit Anwendungen in der Wasserwirtschaft: Teilprojekt Mehrskalenmodellierung und Systemreduktion für Grundwasserströmungen ( – )
participations in bmbf-joint project: Bundesministerium für Bildung und Forschung | Förderkennzeichen: 03OMPAF1
- SFB 656 B07 - Mathematische Modellierung atherosklerotischer Plaque-Entstehung basierend auf multi-parametrischen Bildgebungsdaten ( – )
Publikationen
- . . ‘The DUNE-FEM-DG module.’ Archive of Numerical Software 5, Nr. 1: 21––61. doi: 10.11588/ans.2017.1.28602.
- . . ‘Efficient Parallel Simulation of Atherosclerotic Plaque Formation Using Higher Order Discontinuous Galerkin Schemes.’ In Finite Volumes for Complex Applications VII-Elliptic, Parabolic and Hyperbolic Problems, edited by , 617–625.: Springer International Publishing. doi: 10.1007/978-3-319-05591-6_61.
Wissenschaftliche Vorträge
- Girke, Stefan (): ‘Efficient Parallel Simulation of Atherosclerotic Plaque Formation Using Higher Order Discontinuous Galerkin Schemes’. SIAM Conference on the Life Sciences, Boston, .
- Malkmus, Tobias; Girke, Stefan (): ‘The Dune-Fem-DG module – towards a unified multiphysics framework –’. PDESoft 2016, Warwick, .
- Stefan Girke (): ‘Mathematical Modeling and Simulation of Atherosclerotic Plaque Formation.’ Skiseminar, Kleinwalsertal, .
- Girke, Stefan (): ‘Efficient Numerical Modeling of Atherosclerotic Plaque Formation’. Molecular Imaging School - MIS 2015, Wien, .
- Girke, Stefan (): ‘Atherosclerosis, Multiphysics and DUNE-FEM-DG’. Dune User Meeting 2015, Heidelberg, .
- Girke, Stefan (): ‘Efficient Parallel Simulation of Atherosclerotic Plaque Formation Using Higher Order Discontinuous Galerkin Schemes’. I.R.I.S., Bergen, .
- Girke, Stefan (): ‘Mathematical Modeling and Simulation of Atherosclerotic Plaque Formation’. Skiseminar 2015, Kleinwalsertal, .
- Girke, Stefan (): ‘Efficient Parallel Simulation of Atherosclerotic Plaque Formation Using Higher Order Discontinuous Galerkin Schemes ’. The International Symposium of Finite Volumes for Complex Applications VII , Berlin, .
- Girke, Stefan (): ‘Modelling of atherosclerotic plaque formation using the software framework DUNE’. Inflammation et résistance aux thérapies, Lyon, .
- Girke, Stefan (): ‘Mathematical modelling of atherosclerotic plaque formation’. Dune User Meeting 2013, Aachen, .
- Girke, Stefan (): ‘Unified software framework for hybridized discretization methods ’. PDESoft 2012, Münster, .
Stefan Wierling
Professur für Angewandte Mathematik, insbesondere Numerik (Prof. Ohlberger)
Lehre
Sommersemester 2015
Sommersemester 2014
Sommersemester 2013
Praktikum Wissenschaftliches Rechnen
Wintersemester 2012/13
Praktikum Wissenschaftliches Rechnen
Sommersemester 2012
Software
Eigene Module und Projekte mit aktiver Beteiligung
DUNE-Fem-Localfunctions
A Module for using DUNE-Localfunctions in DUNE-FEM Project page
DUNE-Hybridfem
A Module for using Hybridized Discontinuous Galerkin Methods Project page
DUNE-Fem-DG
A Module for using Higher Order Discontinuous Galerkin Methods Project page
DUNE-Fem-Blood
A Module for using Hybridized Discontinuous Galerkin Methods Project page
Diverses
Atherosklerose
Entzündungsprozess von Atherosklerose (2D Simulation, 3D Simulation)
Weitere Projekte
Mathematik und Informatik waren schon immer meine Leidenschaft.
Schon als Schüler entwickelte ich für das Universitäts-Projekt lernserver - indivuelle Rechtschreibförderung die zentrale Diagnose-Komponente für eine individuelle Rechtschreibförderung. Das in C++ (und Visual Basic.Net) geschriebene Programm kommt noch heute zum Einsatz, um zuverlässig einzelne Wörter mit einer hohen Anzahl von Rechtschreibfehlern (z.B. fünf) zu klassifizieren. Die Ergebnisse kommerzieller Produkte wurden um Längen übertroffen.