Neben dem Institut für Informatik beherbergt die Westfälische Wilhelms-Universität weitere Institute und Arbeitsgruppen, an denen Forschung und Lehre mit starkem Bezug zur Informatik durchgeführt wird, insbesondere in Teilgebieten der Angewandten Informatik wie Wirtschaftsinformatik, Geoinformatik, Bioinformatik und medizinische Informatik. Lehrangebote aus diesen Bereichen sind als fachübergreifende Studien auch im Master Informatik anrechenbar und erlauben so vertiefte Einblicke in Anwendungen von Informatiktechniken.