Softwareentwicklung

GitHub repository: https://github.com/DNA-BarKeeper/barkeeper
Aktuelle Version:  1.0.0
Entwickler:  Sarah Wiechers, Kai Müller

BarKeeper ist eine flexible Web-Anwendung für Barcoding-Initiativen um gemeinsames Arbeiten an großen Datensammlungen zu erleichtern.

GitHub repository: https://github.com/bioinfweb/TreeGraph2
Aktuelle Version:  2.15.0 beta (26. April 2019)
Entwickler:  Ben Stöver, Sarah Wiechers, Kai Müller
Download: Treegraph 2.15.0-887 Beta

TreeGraph2 ist ein graphischer Editor für phylogenetische Bäume, der eine große Zahl von Formatierungsoptionen für die Elemente eines Baumes enthält. Außerdem unterstützt er eine beliebig große Anzahl von (sichtbaren oder versteckten) Annotationen (z. B. Support-Werte) für jeden Ast oder Knoten. Diese Annotationen können aus Nexus-Baum-Dateien oder Textdateien mit Daten im Tabellenformat (zum Beispiel Exporte aus einem Tabellenkalkulationsprogramm) importiert werden.

GitHub repository: https://github.com/bioinfweb/JPhyloIO
Aktuelle Version:  1.0.0 (12. Juni 2019)
Entwickler:  Ben Stöver, Sarah Wiechers, Kai Müller
Download: JPhyloIO-complete-1.0.0

Java-Bibliothek für Event-basiertes Lesen und Schreiben verschiedener phylogenetischer Dateiformate mittels einer gemeinsamen Schnittstelle.

Aktuelle Version:  1.4.1 (2. Oktober 2008)
Entwickler:  Kai Müller
Download: Seqstate

Primerdesign, Sequenzstatistik und Indel-Coding nach verschiedenen Schemata