Dr. Aaron Scherzinger
Wissenschaftlicher Mitarbeiter
Tel: +49 251 83 - 32704
scherzinger(AT)wwu.de
Institut für Informatik
Westfälische Wilhelms-Universität Münster
Einsteinstrasse 62
D-48149 Münster
Raum 610
Sprechstunde: nach Vereinbarung
Forschungsschwerpunkte
- Biomedizinische Bildverarbeitung
- Mustererkennung und Maschinelles Lernen
- Wissenschaftliche Visualisierung und Computergrafik
Promotion
Data Exploration in Natural Sciences using Machine Learning and Scientific Visualization
- Betreuer
- Promotionsfach
- Informatik
- Abschlussgrad
- Dr. rer. nat.
- Verleihender Fachbereich
- Fachbereich 10 – Mathematik und Informatik
Preise
- SciVis Contest Award – IEEE VIS: Visualization & Visual Analytics
Lehre
- Projektseminar: Projektseminar: Barista [106120]
(zusammen mit Dominik Drees, Sören Klemm, Xiaoyi Jiang und Benjamin Risse)
- Seminar: Seminar: Deep Learning [104121]
(zusammen mit Sören Klemm, Xiaoyi Jiang und Benjamin Risse) - Projektseminar: Projektseminar: Towards Smart 3D Printing [104123]
(zusammen mit Benjamin Risse) - Projektseminar: Projektseminar: Barista [104120]
(zusammen mit Dominik Drees, Sören Klemm, Xiaoyi Jiang und Benjamin Risse)
- Seminar: Seminar: Maschinelles Lernen und Deep Learning [102117]
(zusammen mit Sören Klemm, Xiaoyi Jiang und Benjamin Risse) - Projektseminar: Projektseminar: Barista for Deep Learning-based Bug Tracking [102116]
(zusammen mit Dominik Drees, Sören Klemm, Xiaoyi Jiang und Benjamin Risse)
- Seminar: Seminar: Maschinelles Lernen und Deep Learning [100122]
(zusammen mit Sören Klemm und Xiaoyi Jiang) - Projektseminar: Projektseminar: Barista - A Rapid Prototyping Tool for Neural Networks [100121]
(zusammen mit Dominik Drees, Sören Klemm und Xiaoyi Jiang)
- Vorlesung: Informatik II - Datenstrukturen und Algorithmen [108381]
(zusammen mit Klaus Hinrichs) - Projektseminar: Projektseminar: Barista - A Rapid Prototyping Tool for Neural Networks [108414]
(zusammen mit Sören Klemm und Xiaoyi Jiang) - Übung: Übungen zur Informatik II - Datenstrukturen und Algorithmen [108382]
(zusammen mit Klaus Hinrichs)
- Projektseminar: Projektseminar: Entwicklung einer Rapid Prototyping Oberfläche zum Trainieren und Testen Neuronaler Netze [106268]
(zusammen mit Xiaoyi Jiang)
- Vorlesung: Informatik II - Datenstrukturen und Algorithmen [104160]
(zusammen mit Klaus Hinrichs) - Projektseminar: Projektseminar: IEEE SciVis Contest 2016 [104167]
(zusammen mit Xiaoyi Jiang, Tobias Brix, Claas Flint und Klaus Hinrichs) - Übung: Übungen zur Informatik II - Datenstrukturen und Algorithmen [104161]
(zusammen mit Klaus Hinrichs)
- Vorlesung/Praktikum: Einführung in die Computergrafik [101350]
(zusammen mit Dimitar Valkov) - Projektseminar: Projektseminar: IEEE SciVis Contest 2015 [101311]
(zusammen mit Tobias Brix und Klaus Hinrichs)
Publikationen
- Drees, D, Scherzinger, A, Hägerling, R, Kiefer, F, und Jiang, X. . „Scalable robust graph and feature extraction for arbitrary vessel networks in large volumetric datasets.“ BMC Bioinformatics 22 (1) 346. doi: 10.1186/s12859-021-04262-w.
- Drees, D, Scherzinger, A, und Jiang, X. . „GERoMe – a method for evaluating stability of graph extraction algorithms without ground truth.“ IEEE Access 7: 21744–21755. doi: 10.1109/ACCESS.2019.2898754.
- Berh, D, Scherzinger, A, Otto, N, Jiang, X, Klämbt, C, und Risse, B. . „Automatic non-invasive heartbeat quantification of Drosophila pupae.“ Computers in Biology and Medicine 93: 189–199.
- Scherzinger, Aaron. . „Data Exploration in Natural Sciences using Machine Learning and Scientific Visualization.“ Dissertationsschrift, Universität Münster.
- Klemm, S, Scherzinger, A, Drees, D, und Jiang, X. . Barista - a graphical tool for designing and training deep neural networks arXiv e-print:1802.04626: CoRR.
- Dierkes, C, Scherzinger, A, und Kiefer, F. . „Three-Dimensional Visualization of the Lymphatic Vasculature.“ In Lymphangiogenesis - Methods and Protocols, Bd. 1846 aus Methods in Molecular Biology, herausgegeben von G Oliver und ML Kahn. New York, NY: Springer. doi: 10.1007/978-1-4939-8712-2_1.
- Scherzinger, A, Hugenroth, P, Rüder, M, Bogdan, S, und Jiang, X. . „Multi-class Cell Segmentation using CNNs with F1-measure Loss Function.“ Beitrag präsentiert auf der Proc. of 40th German Conference on Pattern Recognition (GCPR), Stuttgart
- Seifert, R, Scherzinger, A, Kiefer, F, Hermann, S, Jiang, X, und Schäfers, M. . „Statistical permutation-based artery mapping (SPAM): A novel approach to evaluate imaging signals in the vessel wall.“ BMC Medical Imaging 17 (1): 36:1–36:11..
- Bian, A, Scherzinger, A, und Jiang, X. . „An enhanced multi-label random walk for biomedical image segmentation using statistical seed generation.“ Beitrag präsentiert auf der Proc. of 18th Int. Confernce on Advanced Concepts for Intelligent Vision Systems (ACIVS), Antwerp, Belgium
- Hägerling, R, Drees, D, Scherzinger, A, Dierkes, C, Martin-Almedina, S, Butz, S, Gordon, K, Schäfers, M, Hinrichs, K, Ostergaard, P, Vestweber, D, Goerge, T, Mansour, S, Jiang, X, Mortimer, P, und Kiefer, F. . „VIPAR, a quantitative approach to 3D-histopathology applied to lymphatic malformations.“ JCI Insight 2 (16): e93424.
- Scherzinger, A, Klemm, S, Berh, D, und Jiang, X. . „CNN-based background subtraction for long-term in-vial FIM imaging.“ Beitrag präsentiert auf der Proc. of 17th Int. Conf. on Computer Analysis of Images and Patterns (CAIP), Ystad, Sweden
- Scherzinger, Aaron Brix Tobias, Drees, Dominik Völker Andreas, Radkov, Kiril Santalidis Niko, und Fieguth, Alexander Hinrichs Klaus H. . „Interactive Exploration of Cosmological Dark-Matter Simulation Data.“ IEEE Computer Graphics and Applications 37 (2): 80–89.
- Scherzinger, Aaron, Brix, Tobias, und Hinrichs, Klaus. . „An Efficient Geometric Algorithm for Clipping and Capping Solid Triangle Meshes.“ Beitrag präsentiert auf der 12th Joint Conference on Computer Vision, Imaging and Computer Graphics Theory and Applications (VISIGRAPP 2017) - Volume 1: GRAPP, Porto, Portugal , herausgegeben von Ana Paula Cláudio, Dominique Bechmann und BrazJose.
- Drees, D, Scherzinger, A, und Jiang, X. . „GERoMe - A novel graph extraction robustness measure.“ Beitrag präsentiert auf der Proc. of Int. Workshop on Graph-Based Representations in Pattern Recognition (GbR), Anacapri, Italy
- Scherzinger, A, Kleene, F, Dierkes, C, Kiefer, F, Hinrichs, KH, und Jiang, X. . „Automated Segmentation of Immunostained Cell Nuclei in 3D Ultramicroscopy Images.“ In Bd. 9796 aus Lecture Notes in Computer Science Springer.
- Scherzinger, Aaron Brix Tobias, Drees, Dominik Völker Andreas, Radkov, Kiril Santalidis Niko, und Fieguth, Alexander Hinrichs Klaus H. . „Visualize the Universe: Interactive Exploration of Cosmological Dark Matter Simulation Data.“ Beitrag präsentiert auf der IEEE Visualization Conference 2015 October 25-30, Chicago, Il, USA Wiley-IEEE Press.
- Brix, Tobias, Scherzinger, Aaron, Völker, Andreas, und Hinrichs, Klaus. . „Interactive Position-dependent Customization of Transfer Function Classification Parameters in Volume Rendering.“ Beitrag präsentiert auf der Eurographics Workshop on Visual Computing for Biology and Medicine, VCBM 2015, Chester, England
- Prätorius, Manuel, Scherzinger, Aaron, und Hinrichs, Klaus. . „SKInteract: An on-body interaction system based on skin-texture recognition.“ In Bd. 9299 aus Lecture Notes in Computer Science (including subseries Lecture Notes in Artificial Intelligence and Lecture Notes in Bioinformatics) Springer. doi: 10.1007/978-3-319-22723-8_34.