Offene Reproduzierbare Forschung
- Projektstatus
- abgeschlossen
Beschreibung
‘Open Access’ bezieht sich nicht nur auf eine Art des Publizierens, bei der akademische Veröffentlichungen der allgemeinen Öffentlichkeit bereitgestellt werden. Zunehmend bezeichnet es auch einen Trend in der Wissenschaft, den Forschungsprozess selbst offener und transparenter zu gestalten. Wenn die Wissenschaft selbst auf Open Access umstellt, dann beinhaltet dieser Wechsel den Zugriff auf akademische Publikationen, auf erhobene und generierte Forschungsdaten, auf die einer Publikation zugrunde liegenden Methoden sowie auf Laufzeitumgebungen für Software, die für die Ermittlung der Ergebnisse zum Einsatz kamen. Dadurch werden die in einer Publikation beschriebenen Forschungsergebnisse reproduzierbar und inspizierbar. Die Reproduzierbarkeit von Forschungsergebnissen – also die Fähigkeit experimentelle Prozeduren zu wiederholen und damit zuvor erzielte Ergebnisse zu bestätigen – ist das zentrale Element wissenschaftlichen Arbeitens. In vielen Disziplinen bedeutet Reproduktion von Forschungsergebnissen, dass Versuche nochmals durchgeführt werden, z.B. in einem Labor oder durch erneute Datensammlung im Feld. Zunehmend werden Forschungsergebnisse aber auch durch die numerische Manipulation bereits erhobener Daten erzielt bis hin zu Simulationsexperimenten, die vollständig im Rechner ablaufen.Mit dem Antrag „Offene Reproduzierbare foRschung (ORR)“ zielen wir direkt auf zentrale Aspekte von Open Access ab, indem wir den Austausch von online veröffentlichten Forschungsergebnissen verbessern, die produktive Aneignung ermöglichen und deren Wiederverwendung vereinfachen. Das experimentell ausgerichtete Projekt ORR fokussiert dabei auf technische und organisatorische Aspekte des Publikationsprozesses und das Absichern der möglichst umfassenden Nachnutzbarkeit von Publikationen. Diese Ziele werden durch substanzielle Innovationen im Hinblick auf reproduzierbare Forschung erreicht, einem Bereich also, der von außerordentlicher Bedeutung für wissenschaftliche Veröffentlichungen ist. Von zentraler Bedeutung für das beantragte Projekt ist die Entwicklung einer neuartigen Form für die Erstellung und Bereitstellung von Forschungsergebnissen – nämlich das ausführbare Forschungskompendium (executable research compendium, ERC). Dieses erlaubt nicht nur einem breiten Publikum, den im ERC beschriebenen Forschungsprozess zu reproduzieren und dort berichtete Forschungsergebnisse (Diagramme, Tabellen) zu rekreieren, sondern schafft auch neue Interaktionsmöglichkeiten mit den Ergebnissen bzw. Prozessen, inklusive deren einfacher Rekombinierung und Wiederverwendung. Das zu entwickelnde Containerformat für ERCs wird alle notwendigen Informationen enthalten, um verschiedene Anwendungen zu realisieren bzw. zu unterstützen, wie z.B. One-click reproduce, Langzeitverfügbarkeit, Forschungsinformationssysteme oder Suchanwendungen. Darüber hinaus sorgt es für Rückwirkungsfreiheit zwischen Datenobjekten und technischen Systemen. Aufbauend auf existierenden offenen Standards und Software wird das hier beantragte Projekt Tools und Standards für ERCs entwickeln. Diese werden mithilfe vollständig ausgearbeiteter Anwendungsfälle, die zunächst aus den Geowissenschaften stammen sollen, pilotartig demonstriert und evaluiert. Damit wird ORR einen substantiellen Schritt in Richtung ausführbarer Publikationen als neuem Standard für wissenschaftliche Veröffentlichungen machen. Personen
- Dr. Stephanie Klötgen
- Dr. Markus Konkol
- Professor Dr. Christian Kray
- Jörg Lorenz
- Dr. Daniel Nüst
- Professor Dr. Edzer Pebesma
- Diplom-Geologe Holger Przibytzin
- Marc Schutzeichel
- Dr. Beate Tröger
Publikationen
- . . Infrastructures and Practices for Reproducible Research in Geography, Geosciences, and GIScience Dissertationsschrift, Universität Münster. Zenodo. doi: 10.5281/zenodo.4768096.
- . . A Web service for executable research compendia enables reproducible publications and transparent reviews in geospatial sciences. Zenodo. doi: 10.5281/zenodo.4818119.
- . . AGILE Reproducible Paper Guidelines.: OSF. doi: 10.17605/OSF.IO/CB7Z8.
- . ‘Creating interactive scientific publications using bindings.’ Proceedings of the ACM on Human-Computer Interaction 3, Nr. EICS. doi: 10.1145/3331158.
- . . ‘Guerrilla Badges for Reproducible Geospatial Data Science.’ In Accepted Short Papers and Posters from the 22nd AGILE Conference on Geo‐information Science, edited by . Limassol, Cyprus: Stichting AGILE. doi: 10.31223/osf.io/xtsqh.
- . . How to Read a Research Compendium. https://arxiv.org/abs/1806.09525: arXiv.
- . . Reproducibility Service for Executable Research Compendia: Technical Specifications and Reference Implementation. doi: 10.5281/zenodo.2203844.
- . . ‘In-depth examination of spatiotemporal figures in open reproducible research.’ Cartography and Geographic Information Science 2018. doi: 10.1080/15230406.2018.1512421.
- . . ‘Computational reproducibility in geoscientific papers: Insights from a series of studies with geoscientists and a reproduction study.’ International Journal of Geographical Information Science 2018. doi: 10.1080/13658816.2018.1508687.
- . . ‘Reproducible research and GIScience: an evaluation using AGILE conference papers.’ PeerJ 6: e5072. doi: 10.7717/peerj.5072.
- . „Open Environmental Data Analysis.“ contributed to the EGU General Assembly 2018, Vienna, Austria, . doi: 10.5281/zenodo.1217911.
- . „rocker/geospatial: a flexible runtime environment for geoscientific data analysis.“ contributed to the EGU General Assembly 2018, Vienna, Austria, . doi: 10.5281/zenodo.1216750.
- . . Reproducible research and GIScience: an evaluation using AGILE conference papers. doi: 10.7287/peerj.preprints.26561v1.
- . . The State of Reproducibility in the Computational Geosciences. doi: 10.17605/OSF.IO/KZU8E.
- . . In-depth examination of spatio-temporal figures in open reproducible research. doi: 10.17605/OSF.IO/Q53M8.
- . „Reproducible research bindings.“ contributed to the European Geosciences Union General Assembly 2018, Wien, Österreich, . [accepted / in Press (not yet published)]
- . . Opening Reproducible Research: a research project website and blog. doi: 10.5281/zenodo.1485437.
- . . ‘Reproducible Research is like riding a bike.’ PeerJ Preprints 6, Nr. e27216v1. doi: 10.7287/peerj.preprints.27216v1.
- . „An Architecture for Reproducible Computational Geosciences.“ contributed to the AGILE Annual International Conference on Geographic Information Science, Wageningen, The Netherlands, . doi: 10.5281/zenodo.1478542.
- . „Opening reproducible research (o2r).“ contributed to the Open Science Conference, Berlin, Germany, .
- . . ‘Opening the Publication Process with Executable Research Compendia.’ D-Lib Magazine 23. doi: 10.1045/january2017-nuest.
- . „Executable research compendia in geoscience research infrastructures.“ contributed to the EGU General Assembly 2017, Vienna, Austria, .
- . . ‘Reproducibility and Practical Adoption of GEOBIA with Open-Source Software in Docker Containers.’ Remote Sensing 9, Nr. 3. doi: 10.3390/rs9030290.
- . „Reproducible Earth observation analytics: challenges, ideas, and a study case on containerized land use change detection.“ contributed to the EGU General Assembly 2017, Vienna, Austria, .
- . . ‘Enabling Reproducible OBIA with Open-Source Software in Docker Containers.’ Contributed to the GEOBIA 2016: Solutions & Synergies, Enschede, The Netherlands. doi: 10.3990/2.456.
- . „Sharing environmental models: An Approach using GitHub repositories and Web Processing Services.“ contributed to the EGU General Assembly, Vienna, .
- . „Opening Reproducible Research.“ contributed to the EGU, Vienna, .