Westfälische Wilhelms-Universität Münster: Forschungsbericht 2003-2004 - Institut für Neuro- und Verhaltensbiologie

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2003 - 2004

 

 
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Institut für Neuro- und Verhaltensbiologie

Tel. (0251) 83-2 11 22
Fax: (0251) 83-2 46 86
e-mail: neurover@uni-muenster.de
www: uni-muenster.de/Biologie.NeuroVer/
Badestr. 9
48143 Münster
Direktor: Prof. Dr. C. Klämbt

Forschungsschwerpunkte 2003 - 2004  
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Experimentelle Tumorbiologie
Funktion der Rab GTPasen beim zellulären Transport

 
Die GTPasen der Rab/Ypt - Familie stellen die weitaus größte Gruppe der ras Superfamilie dar. In über 30% aller humanen Tumoren sind ras Proteine in aktivierter, punktmutierter Form zu finden.

Rab1

Rab1a und Rab1b Proteine zeigen eine Lokalisation im Bereich des cis-Golgi-Apparates und scheinen in Transportvorgänge des ersten Schrittes des exozytotischen Weges regulativ involviert zu sein. Durch den Einsatz verschiedener Rab Mutanten im "yeast two hybrid" - System haben wir neue Interaktionspartner identifiziert und analysieren derzeit die funktionelle Bedeutung der Interaktion, der jeweiligen Proteine. So ist es uns gelungen GM130, Iporin und die Mical Proteine als spezifische Interaktionspartner von Rab1 zu identifizieren und die Bindungsdomänen zu lokalisieren. Die Aspekte zur intrazellulären Lokalisation bearbeiten wir mit Hilfe von Zellfraktionierungstechniken und Immunfluoreszenzanalysen. In vivo Experimente mit GFP-markierten Rab1b GTPasen und Effektoren werden ebenfalls durchgeführt. Detaillierte Strukturanalysen werden in Kooperation mit dem MPI Dortmund bearbeitet.

Rab6

Rab6 ist ebenfalls ein Mitglied der Rab/Ypt - Familie und reguliert intrazelluläre Golgi-Transportprozesse. Mit Hilfe eines "yeast two hybrid screens" konnten wir das Dynein/Dynactin - Bindungsprotein Bicaudal D1 (BICD1) und eine Reihe weiterer Proteine als Rab6 Interaktionspartner identifizieren. Die Analysen ergaben, dass diese Interaktionen Rab6-spezifisch und meist Nukleotid-abhängig sind. Nach Lokalisation der Interaktionsdomänen durch Konstruktion zahlreicher Deletionsmutanten und Chimären, liegt der Schwerpunkt unserer Untersuchungen derzeit auf der zellulären Lokalisation sowie Studien zur funktionellen Analyse der Interaktionspartner.

Rab11 und seine Rolle im sekretorischen Transportweg

Rab11 befindet sich an “recycling“ Endosomen, dem TGN, und sekretorischen Vesikeln. Erst kürzlich wurden einige Interaktionspartner von Rab11 beschrieben. So konnte gezeigt werden, dass Rab11 mit MyosinVb interagiert und so den Myosinmotor an Transferrinrezeptorhaltige Transportvesikel anheftet. Dennoch ist der genaue Mechanismus, wie Rab11 Proteine die endozytotischen Transportprozesse regulieren bislang noch unklar. Mit “primern“ die 2 von 4 hochkonservierten Sequenzen entsprechen, welche für die GTP-Bindung kleiner ras-verwandter GTPasen in der Hefe essentiell sind, wurde eine “sub-library“ von PCR Produkten generiert, die die Effektorregion dieser GTPasen repräsentiert. Ein Klon, der einem Fragment des Hefechromosoms VII entspricht, konnte als neue GTPase mit 70% Homologie zu Rab11 identifiziert werden und wurde mit Ypt11 bezeichnet. Da ein Ypt11 “knock out“ in der Hefe keine eindeutigen Defekte erkennen ließ und subzelluläre Lokalisationsstudien mit entsprechend markierten Ypt11/Rab11 Proteinen in der Säugerzelle präziser zu verfolgen sind, haben wir inzwischen GFP-markierte Konstrukte des Ypt11 Gens hergestellt und deren Expression in Säugerzellen mit Fluoreszenz- und konfokaler Laserscanningmikroskopie untersucht. In Ko-Lokalisationsstudien mit CFP-markiertem Rab11 und Rhodamin-markiertem Transferrin konnten wir nachweisen, dass transfiziertes Ypt11-GFP in Säugerzellen ebenfalls den “recycling“ Endosomen zugeführt wird. Weiterhin haben wir Ypt11GFP und Rab11CFP Mutanten hergestellt, die nicht mehr in der Lage sind, GTP zu binden. Nach Expression in Säugerzellen sind beide mutierte Proteine nicht mehr an endosomalen Kompartimenten lokalisiert, sondern verbleiben im Zytoplasma. Mit neuer Methodik werden wir der Frage nachgehen, welche Faktoren für die identische Lokalisation der beiden GTPasen Rab11 und Ypt11 in der Säugerzelle verantwortlich sind. Da beide Proteine nur eine eingeschränkte Homologie zeigen, gehen wir davon aus, das dass korrekte “targeting“ von bislang unbekannten Effektoren/Regulatoren gesteuert wird.

Drittmittelgeber:

Deutsche Forschungsgemeinschaft, Industrie, Villigst-Stiftung, Studienstiftung des Deutschen Volkes, NRW, WWU, Fonds der Chem. Industrie

Beteiligte Wissenschaftler:

Prof. Dr. A. Barnekow (Leiterin), Dr. M. Kail, Dr. J. Kremerskothen, Dr. T. Weide (Cilian, Münster), Dr. M. Bayer, Dipl. Biol. K. Bilbilis, Dr. M. Köster, Dipl. Biol. M. Konczal, Dr. T. Matanis, Dipl. Biol. I.Teber, Dipl. Biol. J. Fischer, Dipl. Biol. C. Michel, Dr. J. Gromoll und Dipl. Biol. V. von Schönfeld (Institut für Reproduktionsmedizin, WWU Münster), Prof. Dr. A. Wittinghofer, Dr. R. Ahmadian, Dr. A. Rak und Dipl. Biol. L. Blumenstein (MPI Dortmund), Dr. C. Hoogenraad (MIT Cambridge, USA), Dr. A. Akhmanova und P. Wulf (Erasmus Univ. Rotterdam, Niederlande), Prof. Dr. B. Goud, und Dr. F. Nagaro (Inst. Curie, Paris, Frankreich), Prof. Dr. I. G. Macara (Univ. Virginia, Charlottesville, USA), M. Hollinshead (Dept. of Virology, Wright Fleming Building, London, UK), Dr. D. Vaux (Sir William Dunn School of Pathology, Oxford University), Prof. Dr. D. Gallwitz (MPI Göttingen).

Veröffentlichungen:

Matanis, T., Akhmanova, A., Wulf, P., Del Nery, E., Weide, T., Stepanova, T., Galjart, N., Grosveld, F., Goud, B., De Zeeuw, C., Barnekow, A., Hoogenraad, C.: Bicaudal-D regulates COPI-independent Golgi-ER transport by recruiting the dynein-dynactin motor complex. Nature Cell Biol. 4, 986-992 (Dec. 2002).

Weide, T., Teuber, J., Bayer, M., Barnekow, A.: MICAL-1 isoforms, novel rab1 interacting proteins. Biochem. Biophys. Res. Commun. 306, 79-86 (2003).

Matanis, T., Hoogenraad, C., Akhmanova, A., Barnekow, A.: Identification of BICD as a new effector protein of Rab6. Europ. J. Cell Biol. 82 , 115 (2003).

Teuber, J., Weide, T., Barnekow, A.: A novel Rab1 interacting protein linking the Golgiapparatus to intermediate filaments. Europ. J. Cell Biol. 82 , 119 (2003).

Kail, M., Hollinshead, M., Kaufmann, M., Böttcher, J., Barnekow, A.: Yeast Ypt11 is targeted to recycling endosomes in mammalian cells. Europ. J. Cell Biol. 83, 84 (2004).

 

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