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Compiler
MPI
Als Standard MPI-Version sollte Intel MPI in Version 4 verwendet werden. Das entsprechende Modul wird per
module add mpi/intel/4.0.0.028
geladen.
Weitere Varianten:
mpi/intel/3.2.2.006 |
Ältere Version, nur aus Kompatibilitätsgründen |
mpi/mpich2/intel/1.2.1p1 |
MPICH2, falls von bestimmten Programmen benötigt |
mpi/mpich2/intel/1.3.1b |
|
mpi/mpich2/intel/1.3.2 |
|
mpi/mvapich2/intel/1.6-rc2 |
MVAPICH2, nur verwenden, falls Intel MPI nicht mit vielen Prozessen läuft |
mpi/mvapich2/intel/stable |
|
mpi/openmpi/gcc/1.4 |
OpenMPI, falls von bestimmten Programmen benötigt, mit GNU-Compiler übersetzt |
mpi/openmpi/intel/1.5.1 |
dito mit Intel Compiler |
Bibliotheken
Debugger/Profiler
Allinea DDT
Es steht eine Lizenz für bis zu 16 Prozesse bereit, die sich alle Nutzer teilen müssen. Deswegen nur so viele Prozesse nur solange verwenden, wie unbedingt notwendig. Zur Verwendung des Programms das Modul
module add ddt/2.6.1
laden, danach lässt sich das GUI über das Kommando
ddt
starten.
Sonstiges
R
Rmpi lässt sich folgendermaßen verwenden:
module rm intel/mpi
module add mpi/openmpi/gcc/1.4
Einen Knoten reservieren
qsub -I -A ...
mpirun -np 8 -machinefile $PBS_NODEFILE --mca
Programm ausführen...
Rmpi wieder beenden:
mpi.close.Rslaves()
mpi.quit()
--
HolgerAngenent - 2011-04-04