Am Forschungsschwerpunkt Teilchenphysik sind folgende Arbeitsgruppen beteiligt:
| Ultrarelativistische Schwerionenphysik | AG Andronic |
| Quantenchromodynamik auf dem Gitter | AG Heitger |
| Astroteilchenphysik mit Neutrinos | AG Kappes |
| Mesonenproduktion an Beschleunigern | AG Khoukaz |
| Theoretische Teilchen-/Astroteilchenphysik | AG Klasen |
| Phänomenologie von Hadron-Beschleunigern | AG Kulesza |
| Teilchenkosmologie Münster | AG Schmitz |
| Astroteilchenphysik mit Neutrinos und dunkler Materie | AG Weinheimer |