A.6: Analyse von Bewegung in Zellsysytemen

Beteiligte: Martin Burger, Timo Betz, Karin Busch, Christian Engwer, Sergei Gorlatch, Xiaoyi Jiang, Christian Klämbt, Maja Matis, Mario Ohlberger, Heymut Omran, Erez Raz, Albrecht Schwab, Angela Stevens, Timo Strünker, Dietmar Vestweber, Roland Wedlich-Söldner, Benedikt Wirth

Manuelle Techniken zur Analyse und Interpretation der Bildgebung zellulärer und subzellulärer Dynamik werden heute immer schwieriger, aufgrund der enormen Datenmengen, visueller Grenzen in 3D und auch wegen der Komplexität der betrachteten Prozesse. Deshalb werden automatische Bildanalyse und mathematische Modellierung benötigt, die in diesem Projekt behandelt werden. Das Projekt kann auch als eine quantitative bzw. mathematische Implementierung des CiM-Konzepts verstanden werden: Sein zentrales Ziel ist es, neue Methoden zu entwickeln um Bilddaten und mathematische Modellierung zu verknüpfen, was zu neuen Einblicken in Fällen führen soll, wo direkte experimentelle Untersuchungen an ihre Grenzen stoßen. Diese methodischen Entwicklungen im Bereich der Mathematik und Informatik werden durch enge interdisziplinäre Zusammenarbeit innerhalb des Clusters voran getrieben. Der Fokus liegt auf der Entwicklung neuer Techniken zum Tracking von Immun- und Keimzellen, inklusive deren dynamischer Formänderung und intrazellulärer Prozesse. Insbesondere sollen auch Ansätze zur simultanen Analyse der Zellmigration und von Phenotypänderungen entwickelt, automatische Bildanalyse verbessert und mathematische Modellierung als fundamentales Werkzeug zur quantitativen und qualitativen Analyse von Bilddaten etabliert werden.

Geförderte Projekte

FF-2016-06 – FIM4D: Automated FIM-based in-vial activity monitoring and tracking for locomotion analysis of Drosophila larvae
Projektleitung: Xiaoyi Jiang, Christian Klämbt
Projektlaufzeit: 07/2016 - 06/2017

FF-2014-06 – Analysis of cell-cell interactions during neuronal migration in the developing cortex by live cell imaging and cell shape quantification
Projektleitung: Martin Burger, Andreas Püschel
Projektlaufzeit: 07/2014 - 06/2016
 
FF-2013-33 – Analyse von Leukodiapedese durch 4D mathematische Bild- und Bewegungsanalyse
Projektleitung: Dietmar Vestweber, Christoph Brune
Projektlaufzeit: 07/2013 - 06/2015