Westfälische Wilhelms-Universität Münster: Forschungsbericht 2003-2004 - Institut für Medizinische Physik und Biophysik

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Forschungsbericht
2003 - 2004

 

 
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Forschungsschwerpunkte 2003 - 2004  
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Biomedizinische Analytik
Fourier Transform Ionen Zyklotron Resonanz Massenspektrometrie in der Biomedizinischen Analytik

 
Die hochauflösende FT-ICR Massenspektrometrie von oligo- und polymeren komplexen Kohlenhydraten und Proteinen, die als Komponenten der extrazellulären Matrix an der Morphogenese, Zellproliferation, -differenzierung und -regeneration beteiligt sind, wird seit dem Frühjahr 2001 betrieben. Weiterhin wird diese Technik zur Strukturaufklärung von Glykokonjugaten, die eine wichtige Rolle bei Erbkrankheiten wie Congenital Disorders of Glycosylation (CDG) und Schindler's Disease spielen, angewendet. FT-ICR-Massenanalysatoren besitzen eine Reihe von herausragenden Eigenschaften, wie z.B. hohe Empfindlichkeit, hohe Auflösung, hohe Massengenauigkeit sowie die Fähigkeit zur Speicherung von Ionen über einen langen Zeitraum. Diese Eigenschaften ermöglichen Experimente zur Bestimmung von Molekulargewichten mit höchster Massenauflösung (größer 1.000.000) und hoher Massengenauigkeit (typischerweise mit einer Abweichung kleiner 1 ppm). Es konnte gezeigt werden, daß diese Eigenschaften hervorragend zur Analyse von komplexen Analytgemischen aus verschiedenen Körperflüssigkeiten geeignet sind. Beispielsweise konnten in Urinproben bis zu 200 unterschiedliche Glykokonjugatspezies mit Hilfe eines einzigen Spektrums identifiziert werden. Insbesondere das hohe Auflösungsvermögen und die hohe Massengenauigkeit von ICR-Analysatoren macht diese zu einem idealen Werkzeug zur Untersuchung und Charakterisierung von nicht-kovalenten Protein-Substratkomplexen.Die Durchführung von mehrstufigen Tandem-MS Experimenten (MSn) kann beispielsweise zur Sequenzierung von Oligomeren genutzt werden. Verschiedene Techniken zur gezielten Anregung von Ionen, wie z.B. Sustained Off-Resonance Irradiation Collision-Induced Dissociation (SORI-CID), Infrared Multiphoton Dissociation (IRMPD) und Electron Capture Dissociation (ECD) wurden in unserem Labor etabliert und zur strukturellen Charakterisierung verschiedenster Analytspezies genutzt. Speziell die ECD wurde zur strukturellen Charakterisierung von glycosylierten Peptiden angewendet. Es konnte gezeigt werden, daß neben der Aminosäuresequenz auch die Positionen der labilen Glykansubstituenten eindeutig bestimmt werden können. Weitergehende Untersuchungen zur Fragmentierung von hypervalenten Radikalkationen ergaben hochinteressante neue mechanistische Aspekte vor allem in Bezug auf Wasserstofftransferprozesse, die interessante neue Perspektiven für die Glykonkonjugatanalytik bieten.

Einen weiterer Forschungsschwerpunkt stellt die Kopplung von Mikrofluidiksystem-Ionisierungstechniken mit ICR-Massenanalysatoren dar. Die ESI-Ionenquelle wurde mit einem neuartigen vollautomatischen Chip-basierten Roboter und mit Chip-Mikrosprayern gekoppelt. Hierzu wurden neue Schnittstellen konstruiert und implementiert. Es konnte gezeigt werden, daß sich diese Mikrofluidiksysteme hervorragend in der Glycokonjugatanalytik eignen, da sie stabile Elektrospraybedingungen, hohe Reproduzierbarkeit, eine reduzierte Fragmentierung innerhalb der Ionenquelle, d. h. milde Ionisationsbedingungen sowie eine hohe Ionisierungseffektivität bieten.

Kooperationen:

Dr. Baykut (Bruker Daltonik, Bremen), Dr. Witt (Bruker Daltonik, Bremen), Prof. Marshall (Ion Cyclotron Resonance Program, National High Magnetic Field Laboratory, Florida State University,Tallahassee, FL, USA), Dr. Hakansson (Ion Cyclotron Resonance Program, National High Magnetic Field Laboratory, Florida State University, Tallahassee, FL, USA), Prof. Kresse (Institut für Physiologische Chemie und Pathobiochemie, Universität Münster), Dr. Hofsteenge (Friedrich-Miescher-Institut, Basel, Schweiz), Prof. Vestweber (ZMBE Universität Münster), H. Cederquist (Department of Chemistry, Biotechnology and Food Science, Agricultural University of Norway), V.G.H. Eijsink (Department of Chemistry, Biotechnology and Food Science, Agricultural University of Norway) M. Sorle, (Department of Chemistry, Biotechnology and Food Science, Agricultural University of Norway), Dipl.-Chem. S. Bahrke (Universität Potsdam, Institut für Chemie), Prof. M. Peter (Universität Potsdam, Institut für Chemie).

Projektdauer:

ab 2001

Drittmittelgeber:

Deutsche Forschungsgemeinschaft (SFB 492; Projekt Z2), Deutsche Forschungsgemeinschaft (Pe 415/14-1), EU (Nano2life)

Beteiligte Wissenschaftler:

Dipl.-Phys. Laura Bindila, Dipl.-Phys. Martin Froesch, Dr. Iris Meisen, Dr. Michael Mormann, Prof. Dr. Johannes Müthing, PD Dr. Gottfried Pohlentz, Dr. ˇeljka Vukelić, Dr. Alina Zamfir

Veröffentlichungen:

Froesch, M., L. Bindila, A. Zamfir, J. Peter- Katalinić. Sialylation analysis of O-glycosylated sialylated peptides from urine of patients suffering from Schindler's disease by Fourier transform ion cyclotron resonance mass spectrometry and sustained off-resonance irradiation collision-induced dissociation. Rapid Comm. Mass Spectrom. 17 (2003) 2822-2832.

Mormann, M. and J. Peter-Katalinić. Improvement of electron capture efficiency by resonant excitation. Rapid Commun. Mass Spectrom. 17 (2003), 2208-2214.

Froesch, M., A.D. Zamfir, J. Peter-Katalinić. Mapping of O-glycosylated amino acids related to Schindler's Disease by negative ion NanoESI-FT ICR MS and SORI-CID at 9.4 T. Proceedings of the 51st ASMS Conference on Mass Spectrometry and Allied Topics, Montreal, Canada, June 8-13, 2003, (CD Rom publication).

Mormann, M., M.G. Peter, J. Peter-Katalinić Improvement of electron capture dissociation efficiency by resonant excitation and its application to sequencing of modified peptides. Proceedings of the 51st ASMS Conference on Mass Spectrometry and Allied Topics, Montreal, Canada, June 8-13, 2003, (CD Rom publication).

Bindila, L., M. Froesch, N. Lion, J. S. Rossier, H. H. Girault, A. Zamfir, J. Peter-Katalinić
Thin polymer chip coupled to Fourier Transform Ion Cyclotron Resonance Mass Spectrometry for glycopeptide screening. Glycoconjugate J. 21 (2004) 400.

Bindila, L., M. Froesch, N. Lion, ˇ. Vukelić, J. S. Rossier, H. H. Girault, J. Peter-Katalinić, A. Zamfir. A thin chip microsprayer system coupled to Fourier transform ion cyclotron resonance mass spectrometry for glycopeptide screening. Rapid Commun. Mass Spectrom. 18 (2004) 2913 - 2920.

Froesch, M., L. Bindila, G. Baykut, M. Allen, J. Peter-Katalinić, A. Zamfir. Coupling of fully automated ChipESI to FT-ICR Mass Spectrometry for High-Performance Glycoscreening and Sequencing. Glycoconjugate J. 21 (2004) 404.

Froesch, M., L. Bindila, M. Allen, G. Baykut, J. Peter-Katalinić, A. Zamfir. Coupling of fully automated chip electrospray to Fourier transform ion cyclotron resonance mass spectrometry for high-performance glycoscreening and sequencing. Rapid Commun. Mass. Spectrom. 18 (2004) 3084 - 3092.

Froesch, M., L. Bindila, Z. Vukelić, J. Peter-Katalinić, A. Zamfir. Implementation of chip electrospray mass spectrometry in structural glycobiology. Glycoconjugate J. 21, (2004) 398.

Froesch, M., L. Bindila, ˇ. Vukelić, S. Kalanj-Bognar, A. Zamfir, J. Peter-Katalinić. Fourier Transform Ion Cyclotron Resonance Mass Spectrometry of Sialylated Glycosphingolipids from Human Brain Biopsies. Proceedings of the 52nd ASMS Conference on Mass Spectrometry and Allied Topics, Nashville, Tennessee, USA, May 23 - 27, 2004 (CD Rom publication).

Vakhrushev, S.Y., M. Mormann, J. Peter-Katalinić. Identification of complex glycoconjugates related to congenital disorders of glycosylation by FT-ICR MS and MS/MS in combination with a computational algorithm. Proceedings of the 52nd ASMS Conference on Mass Spectrometry and Allied Topics, Nashville, Tennessee, USA, May 23 - 27, 2004 (CD Rom publication).

Mormann, M., B. Maček, A. Gonzalez de Peredo, J. Hofsteenge, J. Peter-Katalinić. Structural studies on protein O-fucosylation by electron capture dissociation. Int. J. Mass Spectrom. 234 (2004) 11 - 21.

Mormann, M., G. Pohlentz, M.G. Peter, J. Peter-Katalinić. ECD of glycoconjugate ions. Glycoconjugate J. 21 (2004) 411.

Mormann, M., S. Bahrke, M.G. Peter, J. Peter-Katalinić. Electron capture dissociation of glycoconjugates. In: Ashcroft, A.E., Brenton, G., Monaghan, J.J. (Eds.), Advances in Mass Spectrometry, Vol. 16, Elsevier, Amsterdam 2004, CD-ROM Suppl. No. 405.

Zamfir, A., D. Seidler, H. Kresse, M. Mormann, J. Peter-Katalinić. CE-QTOF and FT-ICR for Glycomics of Glycosaminoglycans. In: Ashcroft, A.E., Brenton, G., Monaghan, J.J. (Eds.), Advances in Mass Spectrometry, Vol. 16, Elsevier, Amsterdam 2004, CD-ROM Suppl. No. 448.

 

Ausgewählte Vorträge (V) und Poster (P):

Froesch, M., L. Bindila, A. Zamfir, J. Peter-Katalinić. Analysis and sequencing od sialylated glycopeptides from urine of patients suffering from Schindler's disease by nanoESI-FT-ICR SORI-CID tandem MS. 14th Joint Meeting of the "Studiengruppe Glykobiologie der Gesellschaft für Biochemie und Molekularbiologie", the "Nederlandse Vereinging voor Glycobiologie" and the "Groupe Lillois de Glycobiologie", November 20 - 22, 2003, Lille, France (P).

Mormann, M., H. Paulsen, J. Peter-Katalinić. Electron Capture Dissociation of O-glycosylated peptides: Radical site induced cleavage of glycosidic bonds. 5. Igler MS Tage, Febr. 19 - 21, 2003, Universität Innsbruck, Österreich (P).

Mormann, M., H. Paulsen, J. Peter-Katalinić. Fragmentation of glycosidic bonds during Electron Capture Dissociation of O-glycosylated peptides: charge- versus radical site-induced processes. 36. Diskussionstagung der Deutschen Gesellschaft für Massenspektrometrie (DGMS) 9. - 12. März 2003, Münster (V).

Mormann, M., M. Froesch, J.Peter-Katalinić Electron Capture Dissociation of Peptides: Enhancement of the Electron Capture Process by Resonant Excitation. 36. Diskussionstagung der Deutschen Gesellschaft für Massenspektrometrie (DGMS) 9. - 12. März 2003, Münster (P).

Mormann, M., S. Bahrke, M.G. Peter, J. Peter-Katalinić. Electron capture dissociation of glycoconjugates. 16th International Mass Spectrometry Conference, August 31 - September 5, 2003, Edinburgh, Scotland, UK (P).

Zamfir, A., D. Seidler, H. Kresse, M. Mormann, J. Peter-Katalinić. CE-QTOF and FT-ICR for Glycomics of Glycosaminoglycans. 16th International Mass Spectrometry Conference, August 31 - September 5, 2003, Edinburgh, Scotland, UK (P).

Zamfir, A, D. Seidler, H. Kresse, M. Mormann, J. Peter-Katalinić. Identification of Glycosaminoglycan Glycoforms by Mass Spectrometry. Symposium "Glykane und Glykomimetika in Medizin und Pharmazie", 14. November 2003, Charite-Universitätsmedizin, Berlin (P).

Zamfir, A., D. Seidler, H. Kresse, M. Mormann, J. Peter-Katalinić. Glycomics of Glycosaminoglycans. Glycobiology 2003, December 3 - 6, 2003, San Diego, CA, USA (P).

Bindila, L., M. Froesch, A. Zamfir, S. Usuki, ˇ. Vukelić, R.K. Yu, J. Peter-Katalinić. Negative Ion nanoElectrospray Fourier Transform Ion Cyclotron Resonance Mass Spectrometry of Glycosphingolipids. 37. Diskussionstagung der DGMS, Leipzig, March 7 - 10, 2004 (P).

Bindila, L., M. Froesch, N. Lion, J. S. Rossier, H. H. Girault, A. Zamfir, J. Peter-Katalinić. Thin polymer chip coupled to Fourier Transform Ion Cyclotron Resonance Mass Spectrometry for glycopeptide screening. 15th Joint Meeting of the "Studiengruppe Glykobiologie der Gesellschaft für Biochemie und Molekularbiologie", the "Nederlandse Vereinging voor Glycobiologie" and the "Groupe Lillois de Glycobiologie", November 29 - 30, 2004, Wageningen, Niederlande (P).

Froesch, M., L. Bindila, G. Baykut, M. Allen, J. Peter-Katalinić, A. Zamfir. Coupling of fully automated ChipESI to FT-ICR Mass Spectrometry for High-Performance Glycoscreening and Sequencing. 15th Joint Meeting of the "Studiengruppe Glykobiologie der Gesellschaft für Biochemie und Molekularbiologie", the "Nederlandse Vereinging voor Glycobiologie" and the "Groupe Lillois de Glycobiologie", November 29 – 30, 2004, Wageningen, Niederlande (V).

Froesch, M., L. Bindila, ˇ. Vukelić, A. Zamfir, J. Peter-Katalinić. Ionization and Fragmentation of Highly Sialylated Glycosphingolipids by FT-ICR. 7th European FTMS Conference (EFTMS 2004), Konstanz, March 28 – April 1, 2004 (P).

Froesch, M., ˇ. Vukelić, L. Bindila, A. Zamfir, J. Peter-Katalinić Fourier Transform Ion Cyclotron Resonance Mass Spectrometry of Sialylated Gangliosides from Human Brain Biopsies. 52nd ASMS conference on mass spectrometry and allied topics,
May 23 - 28, 2004, Nashville, Tennessee, USA (P).

Mormann, M., G. Pohlentz, M.G. Peter, J. Peter-Katalinić. ECD of glycoconjugate ions. 15th Joint Meeting of the "Studiengruppe Glykobiologie der Gesellschaft für Biochemie und Molekularbiologie", the "Nederlandse Vereinging voor Glycobiologie" and the "Groupe Lillois de Glycobiologie", November 29 - 30, 2004, Wageningen, Niederlande (P).

Mormann, M., J. Peter-Katalinić. Alkylated cysteine residues loose the side chain under electron capture dissociation conditions. 37. Diskussionstagung der DGMS, Leipzig, March 7 - 10, 2004 (P).

Mormann, M., L. Bindila, M. Froesch, A. Zamfir, J. Peter-Katalinić. FT-ICR MS of Complex Carbohydrates. 7th European FTMS Conference (EFTMS 2004), Konstanz, March 28 - April 1, 2004 (V).

Vakhrushev, S., M. Mormann, J. Peter-Katalinić. Identification of complex glycoconjugates related to congenital disorders of glycosylation by FT-ICR MS and MS/MS in combination with computational algorithm.52nd ASMS conference on mass spectrometry and allied topics, May 23 - 28, 2004, Nashville, Tennessee, USA (P).

Mormann, M. Hochauflösende Massenspektrometrie in der biomedizinischen Analytik. Institute for Analytical Sciences, ISAS, Dortmund, 05.04.2004.

Mormann, M. Analysis of glycoconjugate ions by interaction with electrons.2nd International Uppsala Symposium on electron capture. dissociation of biomolecules and related phenomena, August 25 - 28, 2004, North Berwick, East Lothian, Scotland.

Peter-Katalinić, J., L. Bindila, M. Froesch, M. Mormann, D. agi, S. Vakhrushev, A. Zamfir
Novel Trends in N- and O-Glycoproteomics. 3rd Swedish Proteomics Society Symposium, Lund, Sweden and Copenhagen, Denmark, October 2 - 5, 2004.

 

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