Zentrale Projektgruppen / Serviceeinheiten Integrierte Funktionelle Genomik (IFG)
Die IFG ist eine Technolgieplattform in den Bereichen Proteomik, Genomik und Bioinformatik. Sie bietet den IZKF-Mitgliedern hochwertige analytische Techniken an, die
ihnen aus Kostengründen sonst nicht zugänglich wären. Die Betreuung erfolgt durch hochqualifiziertes Personal, das sowohl Routinemessungen im
Service anbietet als auch wissenschaftliche Projekte bearbeitet. Außerdem werden Schulungen und Kurse angeboten.
In der Proteomik werden proteinanalytische Techniken eingesetzt, um Proteine zu trennen, zu identifizieren und ihre Modifikationen zu bestimmen. Dazu werden folgende
Techniken benutzt: 2D- und Differentielle Gelelektrophorese, mehrdimensionale Flüssigchromatographie, Protein- und Peptidmassenspektrometrie,
Proteinchip-Bioaffinitätsmessungen.
In der Genomik finden Techniken Anwendung, die zur Herstellung und Analyse von Microarrays (z.B. in Gen-Expressionsexperimenten) dienen. Ergänzt werden
diese durch eine Realtime-Analytik sowie eine Pipettier-Robotereinheit. Letztere bietet Arbeitsprogramme für die automatisierte Hochdurchsatz- Prozessierung von
PCR bzw. ELISA Experimenten.
In der Bioinformatik werden das GeneChip-System und
die Zweikanaltechnik administriert und mit GeneData Expressionist die Qualitätskontrolle und Auswertung für diese Experimente durchgeführt.
Außerdem wird an einer eigenen Expressionsdatenbank gearbeitet. Der GeneData Phylosopher dient der Auswertung von Expressionsdaten im Hinblick auf
funktionelle Pathways und Promotorstudien.
Drittmittelgeber:
Beteiligte Wissenschaftler:
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