Fachbereich 13 - Biologie
Institut für Molekulare Mikrobiologie und Biotechnologie
Arbeitskreis Prof. Dr. Susanne Fetzner

Chinolindegradation durch Pseudomonas putida 86:
Charakterisierung der beteiligten Gene und ihre Regulation

Zielsetzung des Vorhabens ist die Aufklärung des 8-Hydroxycumarinweges der Chinolindegradation durch Charakterisierung der beteiligten Gene und Proteine sowie die Analyse der Regulation dieses Abbauweges. Neben Strukturgenen von katabolen Enzymen sollen insbesondere solche Gene identifiziert werden, deren Produkte an der Assemblierung eines komplexen molybdänhaltigen Enzyms des Abbauweges beteiligt sind.

Zur Charakterisierung des katabolen Genclusters und seiner Regulation werden verschiedene methodische Ansätze kombiniert: DNA-Sequenzanalysen; Funktionsanalyse von (hypothetischen) Genen mit vermuteter Funktion im Abbauweg, beispielsweise durch gene knock out; Transkriptionsanalysen; Untersuchung eines hypothetischen Transkriptionsaktivators und von Promotoraktivitäten.

Durch Vergleich des Proteinmusters Chinolin- und/oder 1H-2-Oxochinolin-induzierter Zellen mit ansonsten unter gleichen Bedingungen auf anderen Kohlenstoffquellen gezüchteten Zellen soll außerdem versucht werden, bisher nicht bekannte Proteine des Abbauweges zu identifizieren.

Drittmittelgeber:

Deutsche Forschungsgemeinschaft

Beteiligte Wissenschaftlerinnen:

Prof. Dr. Susanne Fetzner (Leiterin), Dipl.-Biol. Birgit Goldenstedt