Kooperationen an der Universität Münster bestehen außerhalb des Fachbereichs Biologie, mit den Medizinischen Einrichtungen (Zentrum für Neurologie, Hämatologie und Onkologie, dem Zentrum für Molekularbiologie der Entzündungen, Neuropathologie, dem Institut für Reproduktionsmedizin) sowie Instituten für Biochemie und Anorganische Chemie des Fachbereichs Chemie, dem Institut für Informatik und dem Max-Planck-Institut für molekulare Biomedizin.